Trong đó, Bộ Giao thông vận tải sẽ có 23 tổ chức, bao gồm:
- Vụ Kế hoạch - Đầu tư.
- Vụ Tài chính.
- Vụ Kết cấu hạ tầng giao thông.
- Vụ Vận tải.
- Vụ Pháp chế.
- Vụ Khoa học - Công nghệ và Môi trường.
- Vụ Hợp tác quốc tế.
- Vụ Tổ chức cán bộ.
- Thanh tra.
- Văn phòng.
- Cục Đường bộ Việt Nam.
- Cục Đường cao tốc Việt Nam.
- Cục Hàng hải Việt Nam.
- Cục Hàng không Việt Nam.
- Cục Đường sắt Việt Nam.
- Cục Đường thủy nội địa Việt Nam.
- Cục Đăng kiểm Việt Nam.
- Cục Quản lý đầu tư xây dựng. (Hiện hành là Cục Quản lý xây dựng và Chất lượng công trình giao thông)
- Trung tâm Công nghệ thông tin.
- Viện Chiến lược và Phát triển giao thông vận tải.
- Trường Cán bộ quản lý giao thông vận tải.
- Báo Giao thông.
- Tạp chí Giao thông vận tải.
So với hiện hành, tách Tổng Cục Đường bộ Việt Nam thành Cục Đường bộ Việt Nam và Cục Đường cao tốc Việt Nam.
Bỏ Vụ An toàn giao thông, Vụ Quản lý doanh nghiệp, Vụ Đối tác công-tư, Cục Y tế giao thông vận tải.
Xem thêm tại Nghị định 56/2022/NĐ-CP có hiệu lực từ ngày 01/10/2022 thay thế Nghị định 12/2017/NĐ-CP ngày 10/2/2017.